La Pharmacognosie (ou matière médicale) est l'étude de de la composition et des effets des principes actifs ou substances naturelles d'origine animale, végétale ou microbiologique.
Les substances naturelles sont soit des produits chimiques définis extrait d'une plante ou d'un animal, soit un mélange de plusieurs composés (comme dans le cas d'huiles essentielles ou d'extrait de Ginkgo biloba) soit enfin une partie de la plante utilisée en thérapeutique (écorce de quinquina par exemple).

   Ces pages n'ont pas pour but de dresser une liste exhaustive de tous les composés issus des plantes ou d'animaux utilisés en thérapeutique, mais plutôt de présenter quelques familles importantes de composés. Pour chaque famille abordée, seront présentés la structure chimique, l'activité pharmacologique et les principales plantes d'où sont tirés ces composés.